যেহেতু টমেটো ব্রাউন রুগোজ ফ্রুট ভাইরাস বিশ্বজুড়ে টমেটো এবং গোলমরিচ গাছকে সংক্রামিত করে, বীজ কোম্পানিগুলি একটি প্রতিরোধী টমেটো প্রজননের জন্য কাজ করছে।
টমেটোর জিনোমিক সিকোয়েন্সিং প্রকল্পের সূচনার আগেও টমেটো প্রজননকারীদের কাছে সমৃদ্ধ জেনেটিক এবং জিনোমিক সংস্থান উপলব্ধ ছিল। বৃহৎ টমেটো জার্মপ্লাজম সংগ্রহ বহুদিন ধরে বিভিন্ন স্থানে প্রতিষ্ঠিত হয়েছে। বিশ্বজুড়ে জিনব্যাঙ্কে 75,000টিরও বেশি টমেটো অ্যাক্সেস সংরক্ষিত আছে। সবচেয়ে বড়গুলির মধ্যে একটি হল জেনেভা, এনওয়াই-এর USDA জিনব্যাঙ্ক৷
টমেটো জিনোমের সিকোয়েন্সিং 2005টি দেশের মধ্যে একটি বহুজাতিক প্রচেষ্টা হিসাবে 14 সালে শুরু হয়েছিল এবং 2012 সালে সম্পন্ন হয়েছিল৷ এই প্রচেষ্টাগুলি কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা, মেশিন লার্নিং এবং উন্নত অ্যালগরিদমগুলির প্রয়োগের মাধ্যমে ব্যাপকভাবে ত্বরান্বিত হয়েছে জেনেটিক এবং ফেনোটাইপিক ডেটা বিশ্লেষণ করার জন্য৷
টমেটো প্যান-জিনোম
2020 সালে বয়েস থম্পসন ইনস্টিটিউটের গবেষকরা আরও সম্পূর্ণ এবং দরকারী টমেটো প্যান-জিনোম তৈরি করতে বন্য টমেটোগুলির জন্য একটি উচ্চ-মানের রেফারেন্স জিনোম তৈরি করেছেন। তারা জিনোমের কিছু অংশ আবিষ্কার করেছে যা ফলের গন্ধ, আকার এবং পাকা, চাপ সহনশীলতা এবং রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতার অন্তর্গত। আংশিকভাবে অত্যাধুনিক সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির জন্য ধন্যবাদ যা ডিএনএর অনেক লম্বা টুকরো পড়তে পারে, রেফারেন্স জিনোমটি বিদ্যমান ডাটাবেসের তুলনায় আরও সম্পূর্ণ এবং নির্ভুল।
পুরানো সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি যা ডিএনএর ছোট টুকরো পড়ে একক-বেস স্তরে মিউটেশন সনাক্ত করে। যাইহোক, তারা ডিএনএর বড় অংশের সন্নিবেশ, মুছে ফেলা, বিপরীত বা অনুলিপির মতো কাঠামোগত রূপগুলি খুঁজে পেতে ভাল নয়।
2019 সালে, গবেষকদের একটি আন্তর্জাতিক দল 725টি ফাইলোজেনেটিক এবং ভৌগোলিকভাবে প্রতিনিধিত্বকারী জাত থেকে জিনোম সিকোয়েন্স ব্যবহার করে একটি টমেটো প্যান-জিনোম তৈরি করেছে। এই ডাটাবেসে 4,873টি জিন রয়েছে যা মূল রেফারেন্স জিনোমে পাওয়া যায় নি। বর্তমান/অনুপস্থিত প্রকরণ বিশ্লেষণে টমেটো গৃহপালিত এবং উন্নতির সময় উল্লেখযোগ্য জিনের ক্ষতি এবং জিন এবং প্রবর্তকদের তীব্র নেতিবাচক নির্বাচন প্রকাশ করা হয়েছে।
www.seedworld.com এ সম্পূর্ণ নিবন্ধটি পড়ুন।